Un nuevo capítulo de la vida de Sakura da comienzo cuando, guiada por la llave de los sueños, emprende la búsqueda de las cartas transparentes. En abril, en pleno florecimiento de la primavera, Sakura Kinomoto se matricula en el Instituto Tomoeda, donde comienza su vida como estudiante de secundaria junto a sus amigos, incluido Syaoran Li, que ha regresado de Hong Kong, y una nueva y misteriosa compañera llamada Akiho Shinomoto. Una noche, Sakura tiene un extraño sueño en el que aparece un hombre encapuchado y al despertar todas sus cartas se han vuelto transparentes y han perdido todo su poder… Y por si fuera poco, en la ciudad de Tomoeda se produce un extraño acontecimiento tras otro. Mientras investigan qué es lo que ocurre, Sakura y sus aliados comienzan a utilizar la llave que esta ha encontrado en sueños para encontrar y capturar nuevas cartas transparentes.